Les entreprises de fabrication d'aliments nouvelles dans le domaine de la salubrité alimentaire ou celles dont les systèmes de salubrité alimentaire sont sous-développés seront guidées par l'exploration de sept programmes fondamentaux qui, avec leur plan de salubrité alimentaire, constituent le Code de base de la SQF. Ces sept programmes de base sont les suivants :
L'obtention d'une classe HACCP ou PCQI n'est pas requise, mais elle est fortement recommandée.